
Pelagio fue un romano de familia noble que sirvió como representante papal en Constantinopla. Mientras Vigilio estaba ausente, gobernó la Iglesia en Roma, gastando su propia fortuna en la ciudad hambrienta durante el asedio godo y persuadiendo al rey godo Totila de que perdonara a su pueblo. Fue consagrado en abril de 556, casi un año después de la muerte de Vigilio.
Aceptó el Segundo Concilio de Constantinopla y se esforzó por tranquilizar a los obispos del norte de Italia y de la Galia asegurándoles que no socavaba Calcedonia, aunque un cisma persistió en el norte de Italia. Reorganizó los patrimonios de la Iglesia, arruinados por la guerra gótica, reparó iglesias y reunió ayuda para los pobres, y fue recordado como padre de los pobres. Fue sepultado en San Pedro.