
Agatone era siciliano e si ritiene generalmente che sia stato monaco a Palermo; la tradizione dice che era molto anziano, persino oltre i cento anni, quando divenne papa nel 678. Era noto per la sua affabilità e la sua carità.
Reintegrò San Vilfrido nella sede di York dopo averne ascoltato l'appello in un sinodo lateranense. I suoi legati presiedettero il Terzo Concilio di Costantinopoli (680-81), che di fatto pose fine alla controversia monotelita, sebbene egli morisse prima che i suoi decreti giungessero a Roma; fu sepolto il 10 gennaio 681. Fu chiamato il Taumaturgo per i miracoli a lui attribuiti ed è onorato sia in Oriente sia in Occidente.
La Chiesa lo onora come Santo. Leggi la sua pagina nel dizionario dei santi.